HideFlags.HideAndDontSave

GameObject не отображается в Hierarchy, не сохраняется в Scene и не загружается Resources.UnloadUnusedAssets.

Это наиболее часто используется для GameObjects, которые создаются скриптом и находятся исключительно под контролем скрипта.

using UnityEngine;
using System.Collections;

public class ExampleClass : MonoBehaviour
{
    // Creates a Material that is explicitly created & destroyed by the component.
    // Resources.UnloadUnusedAssets will not unload it, and it will not be editable by the Inspector.
    private Material ownedMaterial;
    void OnEnable()
    {
        ownedMaterial = new Material(Shader.Find("Diffuse"));
        ownedMaterial.hideFlags = HideFlags.HideAndDontSave;
        GetComponent<Renderer>().sharedMaterial = ownedMaterial;
    }

    // Objects created as hide and don't save must be explicitly destroyed by the owner of the object.
    void OnDisable()
    {
        DestroyImmediate(ownedMaterial);
    }
}